De baggerwerkzaamheden in Bunschoten zijn klaar. Van 2005 tot begin 2010 hebben Waterschap Vallei & Eem en de gemeente Bunschoten de vijvers, sloten en grachten gebaggerd. In totaal is er 52.740m3 bagger verwijderd, ook zijn er natuurvriendelijke oevers aangelegd. Daar waar de beschoeiing slecht was, is deze vervangen. Het gaat hierbij om ruim 2300 meter beschoeiing en drie kilometer natuurvriendelijke oevers.
In 2006 zijn de waterbodems in het centrum schoongemaakt. De tweede fase startte in 2007 en werd de westkant van Bunschoten aangepakt. In de derde en laatste fase, van 2008 tot begin 2010, is de zuidoosthoek van Bunschoten schoongemaakt. In totaal is er 52.740m3 bagger verwijderd. Dat zijn ongeveer 3380 vrachtwagens vol. De kwaliteit van de bagger varieerde van schoon tot licht verontreinigd. Deze bagger leverde geen gevaar op voor de volksgezondheid.
Het baggeren wordt vooral betaald uit de belastingheffingen die de inwoners betalen. De totale kosten voor het baggeren komen op € 2.310.000,-. De bijdrage van de gemeente Bunschoten bedroeg € 608.000,-. Daarnaast heeft het Rijk vanuit de zogenaamde Subbiedregeling een subsidie gegeven van € 161.000,-
Op de bodem van iedere vijver of sloot ligt een zwarte laag bagger. Dit is een natuurlijk verschijnsel dat bestaat uit zand, bladeren, dode waterplanten en stof. De sliblaag groeit ongeveer 1 à 2 centimer per jaar. Op een gegeven moment is de laag zo dik dat het de opvang en afvoer van water belemmert.
Op diverse plaatsen in Bunschoten zijn natuurvriendelijke oevers aangelegd. In totaal gaat het om drie kilometer. Deze oevers lopen flauw af naar het water en hebben een geleidelijke overgang van droog naar nat. Dat is aantrekkelijk voor veel planten en dieren. Daarnaast zijn natuurvriendelijke oevers veiliger voor kinderen dan steile oevers.
Na het baggeren zijn de sloten en vijvers helemaal schoon. Het water kan weer voldoende worden opgevangen en afgevoerd. Na het baggeren zagen de sloten en vijvers er eerst nog kaal uit. Het duurt altijd even voordat de nieuwe waterplanten volgroeid zijn.
